В режим гри Фішдом 2 входять три базових проекту - це три акваріума «Морський оазис», «Палац Тритона», «Водна ферма» і проект-бонус «Море тиші».

За результати своєї праці гравець може отримати три золотих кубка і дістатися до необмеженої кількості додаткових акваріумів. У віртуальному магазині можна купити рибок, стильні прикраси для акваріумів і корисне обладнання. Корали, прикраси, водорості треба підбирати так, щоб вони поєднувалися зі стилем обраного акваріума.

У кожному проекті свій стиль. Для «Водної ферми» вдало підійдуть фермерський будиночок, млин, стайня, а для «Морського оазису» необхідно все підбирати по давньоєгипетської тематиці. Але на такі придбання потрібні гроші. Для того щоб їх заробити, треба перейти на ігровий рівень. Натиснувши на кнопку «Старт» відкриється головоломка, в якій пропонується зібрати кілька комбінацій з трьох однакових фішок і більш. За зібрану комбінацію з п'яти фішок присвоюється бонус «Бомба».

Якщо бомбу поміняти місцями з сусідньої фішкою, то вона вибухає і в радіусі двох клітин все розносить навколо себе. У грі передбачений ще один бонус - «Блискавка». Щоб її отримати, треба підірвати сім будь-яких бомб. З ігрового поля вона може прибирати всі фішки одного типу і допомагає гравцеві в найскладніших ситуаціях. З поля необхідно прибрати всі золоті клітки.

Деякі з них покриті бронею, або заблоковані. Тому завдання ускладнюється. Також, в грі необхідно стежити за підказками, включивши свою кмітливість. У розділі гри «Фішіпедія» можна ближче познайомитися з підводним світом і його мешканцями. На кожну рибку є свій опис.

Поступово в процесі гри додаткові матеріали стають доступними. Така гра дуже корисна для розвитку художнього смаку, кмітливості, логічного мислення.